五大临床科室
显微外科到常见病慢病管理 —— 综合医疗布局
内科 —— 常见病慢性病诊疗
阿克苏晨光医院**内科**承担高血压、糖尿病、冠心病、慢性阻塞性肺疾病、消化系统疾病等常见病、慢性病的诊疗，与医院手足外科、骨科、泌尿外科、麻醉科等专科协同提供综合医疗服务。
泌尿外科 —— 体外冲击波碎石
阿克苏晨光医院**泌尿外科**引进先进的体外冲击波碎石设备，常年开展肾结石、输尿管结石、膀胱结石的非侵入性碎石治疗，"不开刀、不住院"，是阿克苏地区结石诊疗的重要力量。
普通外科 —— 体表肿物·阑尾炎疝气
阿克苏晨光医院**普通外科**承担体表肿物切除、腹壁疝修补、阑尾切除等常见外科诊疗，与手足外科、骨科、泌尿外科等专科协同处理复杂创面与多学科病例，是医院综合性外科力量之一。
骨科 —— 四肢骨折·创伤修复
阿克苏晨光医院**骨科**开展四肢骨折复位与固定、关节损伤处理、骨与软组织创伤修复等综合诊疗，与手足外科协同开展肢体功能重建与瘢痕挛缩松解，是阿克苏地区综合性骨科诊疗力量之一。
手足外科 —— 显微修复·断指再植
阿克苏晨光医院**手足外科**是医院重点打造的特色专科，常年开展断指再植、组织瓣移植、周围神经修复、手部先天畸形矫正等显微外科手术。科室配备显微镜及先进手术设备，与阿克苏地区中心血站建立急救用血联动机制，可完成复杂肢（指）体离断的再植及术后管理，帮助周边群众在边疆就近获得显微外科专业诊疗。